Охлаждающие элементы PC/104 обеспечивают отвод тепла от CPU и силовых компонентов. Варианты — пассивные радиаторы, активные вентиляторы и трубки heat-pipe. Используются для SBC, CPU и FPGA-модулей. Производители: VersaLogic, DigiKey, WinSystems, ADLINK, RTD, Diamond Systems, Connect Tech.